“蓬莱学园——全世界屈指可数的巨大高中。地址在东京都台东区宇津帆岛，不过具体位置位于20°50-N，140°31-E（东京正南2500km）。学生数约十万，每年级六十个班。 俗称‘世界最危险的学园’。该学园因来自日本全国乃至世界各地的独特的学生们异想天开的冒险而闻名……” “初恋——学园学生突发的感情，潜伏期间1秒～1小时，伴随发烧、手抖、逃课、学园内流浪等症状。治疗方法是恋爱的成功或完美的失恋，不过成功是罕见的。……↓参照‘追逐’、‘逃课’、‘朝比奈纯一’等项”

那个奇妙的夏天，在被未来抛弃的我们的小城边里，我的青梅竹马悠有第一次向未来跳跃了时空——只有三秒。禁闭在“大山”上的大小姐学校里的飨子号令一下，荒人、凉和我，加上悠有的高中生五人组，开始了“时空间跳跃少女project”。那个夏天，我们分析了无数的时间科幻，沉迷于县道上的跳跃实验之中——但我们并不知道，那将是我们与悠有共同度过的最后一个夏天。

在迎来2005年除夕的东京，一个少年跟在网上认识的名为“17”的人相约一起死去。然而，跟“17”联络用的手机被偷走了。随后手机中的某个自杀预告邮件在17岁的少男少女中传播开来，他们以各自的理由开始寻找少年。另一方便，自杀预告邮件通过网络被大规模散播出去，连暴力团伙也被卷入其中……